Por presuntas irregularidades en el manejo de expedientes, el uso de tácticas dilatorias en temas como la elección de Puebla, y falta de confianza que pone en riesgo la unidad del Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación, el magistrado José Luis Vargas, solicitó a la magistrada presidenta Janine Otálora que renuncie al puesto.
En entrevista con el diario Excelsior, el funcionario comentó que ya se hizo la petición a la magistrada, sin embargo, ella no se ha pronunciado al respecto.